Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AtmQ62388 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AtmQ62388 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AtmQ62388 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AtmQ62388 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AtmQ62388 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AtmQ62388 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtmQ62388 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtmQ62388 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AtmQ62388 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AtmQ62388 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AtmQ62388 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtmQ62388 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtmQ62388 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtmQ62388 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtmQ62388 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtmQ62388 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtmQ62388 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtmQ62388 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtmQ62388 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AtmQ62388 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AtmQ62388 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AtmQ62388 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AtmQ62388 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AtmQ62388 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtmQ62388 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AtmQ62388 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtmQ62388 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtmQ62388 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtmQ62388 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AtmQ62388 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AtmQ62388 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AtmQ62388 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AtmQ62388 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AtmQ62388 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AtmQ62388 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AtmQ62388 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AtmQ62388 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AtmQ62388 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AtmQ62388 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AtmQ62388 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AtmQ62388 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AtmQ62388 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AtmQ62388 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AtmQ62388 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AtmQ62388 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AtmQ62388 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AtmQ62388 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AtmQ62388 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AtmQ62388 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AtmQ62388 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AtmQ62388 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AtmQ62388 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AtmQ62388 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AtmQ62388 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AtmQ62388 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AtmQ62388 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AtmQ62388 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AtmQ62388 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AtmQ62388 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AtmQ62388 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AtmQ62388 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AtmQ62388 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AtmQ62388 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AtmQ62388 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AtmQ62388 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AtmQ62388 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AtmQ62388 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AtmQ62388 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AtmQ62388 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AtmQ62388 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AtmQ62388 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AtmQ62388 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AtmQ62388 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AtmQ62388 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtmQ62388 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AtmQ62388 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AtmQ62388 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AtmQ62388 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AtmQ62388 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AtmQ62388 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AtmQ62388 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AtmQ62388 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms