Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sema4bQ62179 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sema4bQ62179 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema4bQ62179 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema4bQ62179 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema4bQ62179 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema4bQ62179 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sema4bQ62179 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema4bQ62179 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sema4bQ62179 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sema4bQ62179 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema4bQ62179 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Sema4bQ62179 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema4bQ62179 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema4bQ62179 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema4bQ62179 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema4bQ62179 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sema4bQ62179 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sema4bQ62179 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema4bQ62179 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema4bQ62179 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema4bQ62179 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Sema4bQ62179 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema4bQ62179 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sema4bQ62179 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema4bQ62179 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema4bQ62179 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema4bQ62179 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema4bQ62179 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema4bQ62179 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema4bQ62179 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema4bQ62179 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema4bQ62179 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema4bQ62179 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sema4bQ62179 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sema4bQ62179 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sema4bQ62179 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema4bQ62179 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema4bQ62179 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema4bQ62179 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema4bQ62179 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema4bQ62179 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema4bQ62179 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema4bQ62179 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema4bQ62179 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema4bQ62179 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema4bQ62179 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sema4bQ62179 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sema4bQ62179 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema4bQ62179 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sema4bQ62179 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sema4bQ62179 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema4bQ62179 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema4bQ62179 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema4bQ62179 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema4bQ62179 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema4bQ62179 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema4bQ62179 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema4bQ62179 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema4bQ62179 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema4bQ62179 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema4bQ62179 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema4bQ62179 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema4bQ62179 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema4bQ62179 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema4bQ62179 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sema4bQ62179 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema4bQ62179 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema4bQ62179 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema4bQ62179 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema4bQ62179 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema4bQ62179 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sema4bQ62179 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sema4bQ62179 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema4bQ62179 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema4bQ62179 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema4bQ62179 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sema4bQ62179 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema4bQ62179 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms