Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema4aQ62178 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema4aQ62178 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema4aQ62178 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema4aQ62178 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema4aQ62178 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema4aQ62178 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema4aQ62178 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sema4aQ62178 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema4aQ62178 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema4aQ62178 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema4aQ62178 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema4aQ62178 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema4aQ62178 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema4aQ62178 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema4aQ62178 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema4aQ62178 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema4aQ62178 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema4aQ62178 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema4aQ62178 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema4aQ62178 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema4aQ62178 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema4aQ62178 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema4aQ62178 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema4aQ62178 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema4aQ62178 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema4aQ62178 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema4aQ62178 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema4aQ62178 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema4aQ62178 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema4aQ62178 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema4aQ62178 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema4aQ62178 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema4aQ62178 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema4aQ62178 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema4aQ62178 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema4aQ62178 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema4aQ62178 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema4aQ62178 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema4aQ62178 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema4aQ62178 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4aQ62178 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4aQ62178 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema4aQ62178 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema4aQ62178 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema4aQ62178 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema4aQ62178 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema4aQ62178 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema4aQ62178 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema4aQ62178 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema4aQ62178 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema4aQ62178 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema4aQ62178 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema4aQ62178 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema4aQ62178 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema4aQ62178 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema4aQ62178 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema4aQ62178 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema4aQ62178 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema4aQ62178 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema4aQ62178 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema4aQ62178 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema4aQ62178 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema4aQ62178 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4aQ62178 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4aQ62178 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4aQ62178 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4aQ62178 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4aQ62178 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema4aQ62178 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema4aQ62178 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema4aQ62178 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema4aQ62178 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema4aQ62178 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema4aQ62178 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sema4aQ62178 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema4aQ62178 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema4aQ62178 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema4aQ62178 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema4aQ62178 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema4aQ62178 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema4aQ62178 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema4aQ62178 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema4aQ62178 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms