Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PtprrQ62132 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprrQ62132 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprrQ62132 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprrQ62132 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprrQ62132 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprrQ62132 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprrQ62132 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprrQ62132 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprrQ62132 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprrQ62132 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprrQ62132 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprrQ62132 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprrQ62132 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprrQ62132 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprrQ62132 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprrQ62132 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprrQ62132 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprrQ62132 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprrQ62132 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprrQ62132 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprrQ62132 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprrQ62132 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprrQ62132 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprrQ62132 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprrQ62132 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprrQ62132 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprrQ62132 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprrQ62132 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprrQ62132 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprrQ62132 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprrQ62132 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprrQ62132 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprrQ62132 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprrQ62132 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprrQ62132 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PtprrQ62132 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprrQ62132 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprrQ62132 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprrQ62132 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprrQ62132 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprrQ62132 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprrQ62132 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprrQ62132 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprrQ62132 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprrQ62132 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprrQ62132 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprrQ62132 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprrQ62132 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprrQ62132 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprrQ62132 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprrQ62132 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprrQ62132 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprrQ62132 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprrQ62132 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprrQ62132 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprrQ62132 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprrQ62132 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprrQ62132 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprrQ62132 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprrQ62132 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprrQ62132 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprrQ62132 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PtprrQ62132 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprrQ62132 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprrQ62132 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms