Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcbp2Q61990 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcbp2Q61990 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcbp2Q61990 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcbp2Q61990 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcbp2Q61990 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcbp2Q61990 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcbp2Q61990 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcbp2Q61990 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcbp2Q61990 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcbp2Q61990 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcbp2Q61990 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcbp2Q61990 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcbp2Q61990 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcbp2Q61990 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcbp2Q61990 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcbp2Q61990 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcbp2Q61990 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcbp2Q61990 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcbp2Q61990 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcbp2Q61990 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcbp2Q61990 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcbp2Q61990 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcbp2Q61990 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcbp2Q61990 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcbp2Q61990 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcbp2Q61990 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcbp2Q61990 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcbp2Q61990 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcbp2Q61990 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcbp2Q61990 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcbp2Q61990 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcbp2Q61990 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcbp2Q61990 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcbp2Q61990 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcbp2Q61990 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcbp2Q61990 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcbp2Q61990 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcbp2Q61990 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcbp2Q61990 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcbp2Q61990 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcbp2Q61990 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcbp2Q61990 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcbp2Q61990 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcbp2Q61990 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcbp2Q61990 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcbp2Q61990 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcbp2Q61990 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcbp2Q61990 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcbp2Q61990 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcbp2Q61990 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcbp2Q61990 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcbp2Q61990 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcbp2Q61990 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcbp2Q61990 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcbp2Q61990 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcbp2Q61990 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcbp2Q61990 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcbp2Q61990 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcbp2Q61990 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcbp2Q61990 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcbp2Q61990 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcbp2Q61990 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcbp2Q61990 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcbp2Q61990 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcbp2Q61990 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcbp2Q61990 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms