Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PcolceQ61398 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PcolceQ61398 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PcolceQ61398 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PcolceQ61398 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PcolceQ61398 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PcolceQ61398 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PcolceQ61398 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PcolceQ61398 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PcolceQ61398 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PcolceQ61398 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PcolceQ61398 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PcolceQ61398 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PcolceQ61398 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PcolceQ61398 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PcolceQ61398 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PcolceQ61398 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PcolceQ61398 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PcolceQ61398 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PcolceQ61398 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PcolceQ61398 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PcolceQ61398 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PcolceQ61398 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PcolceQ61398 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PcolceQ61398 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PcolceQ61398 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PcolceQ61398 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PcolceQ61398 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PcolceQ61398 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PcolceQ61398 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PcolceQ61398 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PcolceQ61398 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PcolceQ61398 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PcolceQ61398 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PcolceQ61398 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcolceQ61398 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcolceQ61398 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PcolceQ61398 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PcolceQ61398 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PcolceQ61398 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PcolceQ61398 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PcolceQ61398 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PcolceQ61398 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PcolceQ61398 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PcolceQ61398 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PcolceQ61398 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PcolceQ61398 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PcolceQ61398 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PcolceQ61398 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PcolceQ61398 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcolceQ61398 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcolceQ61398 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcolceQ61398 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PcolceQ61398 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PcolceQ61398 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PcolceQ61398 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PcolceQ61398 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PcolceQ61398 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PcolceQ61398 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PcolceQ61398 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PcolceQ61398 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PcolceQ61398 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PcolceQ61398 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PcolceQ61398 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PcolceQ61398 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PcolceQ61398 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PcolceQ61398 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PcolceQ61398 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PcolceQ61398 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PcolceQ61398 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PcolceQ61398 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PcolceQ61398 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PcolceQ61398 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PcolceQ61398 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PcolceQ61398 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PcolceQ61398 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
PcolceQ61398 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PcolceQ61398 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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