Protein–RNA interactions for Protein: Q61146

Ocln, Occludin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OclnQ61146 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OclnQ61146 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OclnQ61146 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OclnQ61146 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OclnQ61146 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OclnQ61146 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
OclnQ61146 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OclnQ61146 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OclnQ61146 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OclnQ61146 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
OclnQ61146 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OclnQ61146 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
OclnQ61146 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OclnQ61146 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OclnQ61146 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OclnQ61146 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OclnQ61146 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OclnQ61146 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OclnQ61146 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OclnQ61146 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OclnQ61146 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OclnQ61146 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OclnQ61146 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OclnQ61146 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OclnQ61146 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OclnQ61146 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OclnQ61146 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OclnQ61146 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OclnQ61146 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
OclnQ61146 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OclnQ61146 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OclnQ61146 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OclnQ61146 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OclnQ61146 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OclnQ61146 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OclnQ61146 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OclnQ61146 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OclnQ61146 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OclnQ61146 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OclnQ61146 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
OclnQ61146 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OclnQ61146 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OclnQ61146 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OclnQ61146 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
OclnQ61146 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OclnQ61146 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OclnQ61146 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OclnQ61146 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OclnQ61146 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OclnQ61146 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OclnQ61146 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OclnQ61146 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OclnQ61146 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OclnQ61146 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OclnQ61146 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OclnQ61146 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OclnQ61146 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OclnQ61146 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OclnQ61146 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OclnQ61146 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OclnQ61146 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OclnQ61146 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OclnQ61146 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OclnQ61146 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OclnQ61146 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OclnQ61146 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms