Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nab1Q61122 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nab1Q61122 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nab1Q61122 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nab1Q61122 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nab1Q61122 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nab1Q61122 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nab1Q61122 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nab1Q61122 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nab1Q61122 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nab1Q61122 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nab1Q61122 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nab1Q61122 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nab1Q61122 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nab1Q61122 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nab1Q61122 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nab1Q61122 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nab1Q61122 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nab1Q61122 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nab1Q61122 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nab1Q61122 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nab1Q61122 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nab1Q61122 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nab1Q61122 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nab1Q61122 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nab1Q61122 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nab1Q61122 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nab1Q61122 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nab1Q61122 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nab1Q61122 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nab1Q61122 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nab1Q61122 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nab1Q61122 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nab1Q61122 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nab1Q61122 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nab1Q61122 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nab1Q61122 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nab1Q61122 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nab1Q61122 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nab1Q61122 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nab1Q61122 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nab1Q61122 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nab1Q61122 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nab1Q61122 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nab1Q61122 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nab1Q61122 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nab1Q61122 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nab1Q61122 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nab1Q61122 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nab1Q61122 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nab1Q61122 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nab1Q61122 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nab1Q61122 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nab1Q61122 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nab1Q61122 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nab1Q61122 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nab1Q61122 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nab1Q61122 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nab1Q61122 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nab1Q61122 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nab1Q61122 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nab1Q61122 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nab1Q61122 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nab1Q61122 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nab1Q61122 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nab1Q61122 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nab1Q61122 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nab1Q61122 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nab1Q61122 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nab1Q61122 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nab1Q61122 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nab1Q61122 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nab1Q61122 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nab1Q61122 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nab1Q61122 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nab1Q61122 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nab1Q61122 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nab1Q61122 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nab1Q61122 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nab1Q61122 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nab1Q61122 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nab1Q61122 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms