Protein–RNA interactions for Protein: Q61096

Prtn3, Myeloblastin, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prtn3Q61096 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prtn3Q61096 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prtn3Q61096 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prtn3Q61096 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prtn3Q61096 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prtn3Q61096 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prtn3Q61096 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prtn3Q61096 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prtn3Q61096 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prtn3Q61096 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prtn3Q61096 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prtn3Q61096 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prtn3Q61096 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prtn3Q61096 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prtn3Q61096 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prtn3Q61096 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prtn3Q61096 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prtn3Q61096 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prtn3Q61096 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prtn3Q61096 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prtn3Q61096 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prtn3Q61096 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prtn3Q61096 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prtn3Q61096 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prtn3Q61096 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prtn3Q61096 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prtn3Q61096 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prtn3Q61096 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prtn3Q61096 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prtn3Q61096 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prtn3Q61096 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prtn3Q61096 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prtn3Q61096 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prtn3Q61096 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prtn3Q61096 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prtn3Q61096 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prtn3Q61096 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prtn3Q61096 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prtn3Q61096 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prtn3Q61096 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prtn3Q61096 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prtn3Q61096 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prtn3Q61096 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prtn3Q61096 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prtn3Q61096 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prtn3Q61096 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prtn3Q61096 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prtn3Q61096 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prtn3Q61096 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prtn3Q61096 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prtn3Q61096 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prtn3Q61096 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prtn3Q61096 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prtn3Q61096 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prtn3Q61096 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Prtn3Q61096 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prtn3Q61096 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prtn3Q61096 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prtn3Q61096 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prtn3Q61096 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prtn3Q61096 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prtn3Q61096 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prtn3Q61096 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prtn3Q61096 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prtn3Q61096 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prtn3Q61096 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prtn3Q61096 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prtn3Q61096 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms