Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
JrkQ60976 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
JrkQ60976 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
JrkQ60976 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
JrkQ60976 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
JrkQ60976 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
JrkQ60976 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
JrkQ60976 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
JrkQ60976 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
JrkQ60976 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
JrkQ60976 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JrkQ60976 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
JrkQ60976 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
JrkQ60976 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
JrkQ60976 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
JrkQ60976 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
JrkQ60976 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
JrkQ60976 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
JrkQ60976 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
JrkQ60976 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
JrkQ60976 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
JrkQ60976 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
JrkQ60976 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
JrkQ60976 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
JrkQ60976 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
JrkQ60976 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
JrkQ60976 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
JrkQ60976 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
JrkQ60976 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
JrkQ60976 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
JrkQ60976 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
JrkQ60976 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
JrkQ60976 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
JrkQ60976 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
JrkQ60976 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
JrkQ60976 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
JrkQ60976 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
JrkQ60976 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
JrkQ60976 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
JrkQ60976 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
JrkQ60976 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
JrkQ60976 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
JrkQ60976 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
JrkQ60976 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
JrkQ60976 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JrkQ60976 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
JrkQ60976 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
JrkQ60976 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
JrkQ60976 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
JrkQ60976 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
JrkQ60976 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
JrkQ60976 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
JrkQ60976 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
JrkQ60976 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
JrkQ60976 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JrkQ60976 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JrkQ60976 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
JrkQ60976 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JrkQ60976 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JrkQ60976 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JrkQ60976 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
JrkQ60976 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JrkQ60976 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JrkQ60976 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JrkQ60976 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
JrkQ60976 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
JrkQ60976 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
JrkQ60976 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JrkQ60976 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JrkQ60976 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
JrkQ60976 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
JrkQ60976 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JrkQ60976 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JrkQ60976 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
JrkQ60976 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JrkQ60976 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JrkQ60976 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
JrkQ60976 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
JrkQ60976 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms