Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ppp1r1bQ60829 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ppp1r1bQ60829 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ppp1r1bQ60829 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ppp1r1bQ60829 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppp1r1bQ60829 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppp1r1bQ60829 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppp1r1bQ60829 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ppp1r1bQ60829 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ppp1r1bQ60829 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ppp1r1bQ60829 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ppp1r1bQ60829 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ppp1r1bQ60829 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ppp1r1bQ60829 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppp1r1bQ60829 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppp1r1bQ60829 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ppp1r1bQ60829 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ppp1r1bQ60829 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ppp1r1bQ60829 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ppp1r1bQ60829 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ppp1r1bQ60829 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ppp1r1bQ60829 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ppp1r1bQ60829 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ppp1r1bQ60829 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ppp1r1bQ60829 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ppp1r1bQ60829 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ppp1r1bQ60829 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppp1r1bQ60829 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ppp1r1bQ60829 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppp1r1bQ60829 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppp1r1bQ60829 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppp1r1bQ60829 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppp1r1bQ60829 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ppp1r1bQ60829 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ppp1r1bQ60829 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppp1r1bQ60829 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppp1r1bQ60829 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppp1r1bQ60829 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ppp1r1bQ60829 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ppp1r1bQ60829 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ppp1r1bQ60829 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ppp1r1bQ60829 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ppp1r1bQ60829 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ppp1r1bQ60829 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ppp1r1bQ60829 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ppp1r1bQ60829 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppp1r1bQ60829 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppp1r1bQ60829 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppp1r1bQ60829 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppp1r1bQ60829 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppp1r1bQ60829 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppp1r1bQ60829 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ppp1r1bQ60829 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ppp1r1bQ60829 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ppp1r1bQ60829 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ppp1r1bQ60829 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ppp1r1bQ60829 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppp1r1bQ60829 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppp1r1bQ60829 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppp1r1bQ60829 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppp1r1bQ60829 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppp1r1bQ60829 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppp1r1bQ60829 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppp1r1bQ60829 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppp1r1bQ60829 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppp1r1bQ60829 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppp1r1bQ60829 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppp1r1bQ60829 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppp1r1bQ60829 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppp1r1bQ60829 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppp1r1bQ60829 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp1r1bQ60829 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp1r1bQ60829 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ppp1r1bQ60829 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ppp1r1bQ60829 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppp1r1bQ60829 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppp1r1bQ60829 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppp1r1bQ60829 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppp1r1bQ60829 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppp1r1bQ60829 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms