Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprnQ60673 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprnQ60673 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprnQ60673 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprnQ60673 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprnQ60673 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprnQ60673 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprnQ60673 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprnQ60673 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprnQ60673 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprnQ60673 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprnQ60673 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprnQ60673 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprnQ60673 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprnQ60673 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprnQ60673 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprnQ60673 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprnQ60673 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprnQ60673 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprnQ60673 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprnQ60673 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprnQ60673 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprnQ60673 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprnQ60673 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprnQ60673 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprnQ60673 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprnQ60673 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprnQ60673 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprnQ60673 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprnQ60673 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprnQ60673 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprnQ60673 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprnQ60673 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprnQ60673 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprnQ60673 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprnQ60673 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprnQ60673 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprnQ60673 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprnQ60673 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprnQ60673 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprnQ60673 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprnQ60673 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprnQ60673 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprnQ60673 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprnQ60673 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprnQ60673 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprnQ60673 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprnQ60673 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprnQ60673 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprnQ60673 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprnQ60673 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprnQ60673 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprnQ60673 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprnQ60673 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprnQ60673 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprnQ60673 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprnQ60673 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprnQ60673 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprnQ60673 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprnQ60673 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprnQ60673 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprnQ60673 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprnQ60673 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprnQ60673 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprnQ60673 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprnQ60673 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprnQ60673 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprnQ60673 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprnQ60673 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprnQ60673 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprnQ60673 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprnQ60673 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprnQ60673 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprnQ60673 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprnQ60673 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprnQ60673 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprnQ60673 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprnQ60673 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprnQ60673 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprnQ60673 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprnQ60673 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprnQ60673 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprnQ60673 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprnQ60673 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprnQ60673 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprnQ60673 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprnQ60673 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprnQ60673 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprnQ60673 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprnQ60673 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprnQ60673 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprnQ60673 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprnQ60673 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprnQ60673 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprnQ60673 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprnQ60673 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprnQ60673 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprnQ60673 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprnQ60673 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprnQ60673 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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