Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tdrd5Q5VCS6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tdrd5Q5VCS6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tdrd5Q5VCS6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd5Q5VCS6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd5Q5VCS6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd5Q5VCS6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd5Q5VCS6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tdrd5Q5VCS6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tdrd5Q5VCS6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tdrd5Q5VCS6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tdrd5Q5VCS6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tdrd5Q5VCS6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd5Q5VCS6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tdrd5Q5VCS6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tdrd5Q5VCS6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tdrd5Q5VCS6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tdrd5Q5VCS6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tdrd5Q5VCS6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd5Q5VCS6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd5Q5VCS6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd5Q5VCS6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd5Q5VCS6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd5Q5VCS6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd5Q5VCS6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd5Q5VCS6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd5Q5VCS6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd5Q5VCS6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd5Q5VCS6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd5Q5VCS6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tdrd5Q5VCS6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tdrd5Q5VCS6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd5Q5VCS6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd5Q5VCS6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd5Q5VCS6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tdrd5Q5VCS6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tdrd5Q5VCS6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tdrd5Q5VCS6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tdrd5Q5VCS6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tdrd5Q5VCS6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tdrd5Q5VCS6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tdrd5Q5VCS6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tdrd5Q5VCS6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tdrd5Q5VCS6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tdrd5Q5VCS6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tdrd5Q5VCS6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tdrd5Q5VCS6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tdrd5Q5VCS6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tdrd5Q5VCS6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd5Q5VCS6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd5Q5VCS6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd5Q5VCS6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd5Q5VCS6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd5Q5VCS6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd5Q5VCS6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tdrd5Q5VCS6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd5Q5VCS6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd5Q5VCS6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd5Q5VCS6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd5Q5VCS6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd5Q5VCS6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd5Q5VCS6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd5Q5VCS6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd5Q5VCS6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tdrd5Q5VCS6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tdrd5Q5VCS6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tdrd5Q5VCS6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tdrd5Q5VCS6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tdrd5Q5VCS6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tdrd5Q5VCS6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tdrd5Q5VCS6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tdrd5Q5VCS6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tdrd5Q5VCS6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tdrd5Q5VCS6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tdrd5Q5VCS6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tdrd5Q5VCS6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tdrd5Q5VCS6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tdrd5Q5VCS6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tdrd5Q5VCS6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tdrd5Q5VCS6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd5Q5VCS6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd5Q5VCS6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd5Q5VCS6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd5Q5VCS6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms