Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tsr1Q5SWD9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tsr1Q5SWD9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tsr1Q5SWD9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tsr1Q5SWD9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tsr1Q5SWD9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tsr1Q5SWD9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tsr1Q5SWD9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tsr1Q5SWD9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tsr1Q5SWD9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tsr1Q5SWD9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tsr1Q5SWD9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tsr1Q5SWD9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Tsr1Q5SWD9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tsr1Q5SWD9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tsr1Q5SWD9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tsr1Q5SWD9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tsr1Q5SWD9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tsr1Q5SWD9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tsr1Q5SWD9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tsr1Q5SWD9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tsr1Q5SWD9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tsr1Q5SWD9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tsr1Q5SWD9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tsr1Q5SWD9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tsr1Q5SWD9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tsr1Q5SWD9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tsr1Q5SWD9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Tsr1Q5SWD9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tsr1Q5SWD9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tsr1Q5SWD9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tsr1Q5SWD9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tsr1Q5SWD9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tsr1Q5SWD9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tsr1Q5SWD9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tsr1Q5SWD9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tsr1Q5SWD9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tsr1Q5SWD9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tsr1Q5SWD9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tsr1Q5SWD9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tsr1Q5SWD9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tsr1Q5SWD9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tsr1Q5SWD9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tsr1Q5SWD9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tsr1Q5SWD9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tsr1Q5SWD9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tsr1Q5SWD9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tsr1Q5SWD9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tsr1Q5SWD9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tsr1Q5SWD9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tsr1Q5SWD9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tsr1Q5SWD9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tsr1Q5SWD9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Tsr1Q5SWD9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tsr1Q5SWD9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tsr1Q5SWD9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tsr1Q5SWD9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tsr1Q5SWD9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tsr1Q5SWD9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tsr1Q5SWD9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tsr1Q5SWD9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tsr1Q5SWD9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tsr1Q5SWD9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tsr1Q5SWD9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tsr1Q5SWD9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tsr1Q5SWD9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tsr1Q5SWD9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tsr1Q5SWD9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tsr1Q5SWD9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tsr1Q5SWD9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tsr1Q5SWD9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tsr1Q5SWD9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tsr1Q5SWD9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tsr1Q5SWD9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tsr1Q5SWD9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tsr1Q5SWD9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tsr1Q5SWD9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tsr1Q5SWD9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tsr1Q5SWD9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Tsr1Q5SWD9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tsr1Q5SWD9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tsr1Q5SWD9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tsr1Q5SWD9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tsr1Q5SWD9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tsr1Q5SWD9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tsr1Q5SWD9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tsr1Q5SWD9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tsr1Q5SWD9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tsr1Q5SWD9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tsr1Q5SWD9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tsr1Q5SWD9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsr1Q5SWD9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsr1Q5SWD9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsr1Q5SWD9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tsr1Q5SWD9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tsr1Q5SWD9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tsr1Q5SWD9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tsr1Q5SWD9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tsr1Q5SWD9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms