Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc42Q5SV66 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc42Q5SV66 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc42Q5SV66 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc42Q5SV66 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc42Q5SV66 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc42Q5SV66 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc42Q5SV66 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc42Q5SV66 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc42Q5SV66 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc42Q5SV66 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc42Q5SV66 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc42Q5SV66 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc42Q5SV66 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc42Q5SV66 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc42Q5SV66 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc42Q5SV66 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc42Q5SV66 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc42Q5SV66 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc42Q5SV66 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc42Q5SV66 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc42Q5SV66 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc42Q5SV66 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc42Q5SV66 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc42Q5SV66 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc42Q5SV66 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc42Q5SV66 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc42Q5SV66 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc42Q5SV66 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc42Q5SV66 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc42Q5SV66 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc42Q5SV66 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc42Q5SV66 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc42Q5SV66 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc42Q5SV66 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc42Q5SV66 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc42Q5SV66 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc42Q5SV66 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc42Q5SV66 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc42Q5SV66 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc42Q5SV66 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc42Q5SV66 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc42Q5SV66 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc42Q5SV66 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc42Q5SV66 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc42Q5SV66 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc42Q5SV66 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc42Q5SV66 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc42Q5SV66 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc42Q5SV66 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc42Q5SV66 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc42Q5SV66 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc42Q5SV66 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc42Q5SV66 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc42Q5SV66 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc42Q5SV66 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc42Q5SV66 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc42Q5SV66 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc42Q5SV66 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc42Q5SV66 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc42Q5SV66 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc42Q5SV66 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc42Q5SV66 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc42Q5SV66 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc42Q5SV66 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc42Q5SV66 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc42Q5SV66 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc42Q5SV66 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc42Q5SV66 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc42Q5SV66 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc42Q5SV66 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc42Q5SV66 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc42Q5SV66 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc42Q5SV66 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc42Q5SV66 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc42Q5SV66 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc42Q5SV66 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc42Q5SV66 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc42Q5SV66 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc42Q5SV66 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc42Q5SV66 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc42Q5SV66 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc42Q5SV66 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc42Q5SV66 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms