Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctc1Q5SUQ9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctc1Q5SUQ9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctc1Q5SUQ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctc1Q5SUQ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctc1Q5SUQ9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctc1Q5SUQ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctc1Q5SUQ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctc1Q5SUQ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctc1Q5SUQ9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctc1Q5SUQ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctc1Q5SUQ9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ctc1Q5SUQ9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ctc1Q5SUQ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctc1Q5SUQ9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctc1Q5SUQ9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctc1Q5SUQ9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctc1Q5SUQ9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctc1Q5SUQ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctc1Q5SUQ9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctc1Q5SUQ9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctc1Q5SUQ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctc1Q5SUQ9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctc1Q5SUQ9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctc1Q5SUQ9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctc1Q5SUQ9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctc1Q5SUQ9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctc1Q5SUQ9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ctc1Q5SUQ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ctc1Q5SUQ9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctc1Q5SUQ9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctc1Q5SUQ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctc1Q5SUQ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctc1Q5SUQ9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctc1Q5SUQ9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctc1Q5SUQ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctc1Q5SUQ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctc1Q5SUQ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctc1Q5SUQ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctc1Q5SUQ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctc1Q5SUQ9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctc1Q5SUQ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctc1Q5SUQ9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctc1Q5SUQ9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctc1Q5SUQ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctc1Q5SUQ9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctc1Q5SUQ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctc1Q5SUQ9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctc1Q5SUQ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctc1Q5SUQ9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctc1Q5SUQ9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctc1Q5SUQ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ctc1Q5SUQ9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ctc1Q5SUQ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctc1Q5SUQ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctc1Q5SUQ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctc1Q5SUQ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctc1Q5SUQ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctc1Q5SUQ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctc1Q5SUQ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctc1Q5SUQ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctc1Q5SUQ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctc1Q5SUQ9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctc1Q5SUQ9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctc1Q5SUQ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctc1Q5SUQ9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctc1Q5SUQ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctc1Q5SUQ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctc1Q5SUQ9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctc1Q5SUQ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctc1Q5SUQ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctc1Q5SUQ9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctc1Q5SUQ9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctc1Q5SUQ9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctc1Q5SUQ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctc1Q5SUQ9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctc1Q5SUQ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctc1Q5SUQ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctc1Q5SUQ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctc1Q5SUQ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctc1Q5SUQ9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctc1Q5SUQ9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctc1Q5SUQ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ctc1Q5SUQ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctc1Q5SUQ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctc1Q5SUQ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctc1Q5SUQ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctc1Q5SUQ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctc1Q5SUQ9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctc1Q5SUQ9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctc1Q5SUQ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctc1Q5SUQ9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctc1Q5SUQ9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctc1Q5SUQ9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctc1Q5SUQ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ctc1Q5SUQ9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctc1Q5SUQ9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctc1Q5SUQ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctc1Q5SUQ9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctc1Q5SUQ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms