Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sft2d1Q5SSN7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sft2d1Q5SSN7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sft2d1Q5SSN7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sft2d1Q5SSN7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sft2d1Q5SSN7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sft2d1Q5SSN7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sft2d1Q5SSN7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sft2d1Q5SSN7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sft2d1Q5SSN7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sft2d1Q5SSN7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sft2d1Q5SSN7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sft2d1Q5SSN7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sft2d1Q5SSN7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sft2d1Q5SSN7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sft2d1Q5SSN7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sft2d1Q5SSN7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sft2d1Q5SSN7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sft2d1Q5SSN7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sft2d1Q5SSN7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sft2d1Q5SSN7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sft2d1Q5SSN7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sft2d1Q5SSN7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sft2d1Q5SSN7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms