Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sun3Q5SS91 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sun3Q5SS91 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sun3Q5SS91 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sun3Q5SS91 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sun3Q5SS91 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sun3Q5SS91 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sun3Q5SS91 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sun3Q5SS91 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sun3Q5SS91 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sun3Q5SS91 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sun3Q5SS91 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sun3Q5SS91 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sun3Q5SS91 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sun3Q5SS91 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sun3Q5SS91 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sun3Q5SS91 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sun3Q5SS91 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sun3Q5SS91 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sun3Q5SS91 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sun3Q5SS91 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sun3Q5SS91 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sun3Q5SS91 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sun3Q5SS91 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sun3Q5SS91 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sun3Q5SS91 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sun3Q5SS91 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sun3Q5SS91 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sun3Q5SS91 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sun3Q5SS91 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sun3Q5SS91 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sun3Q5SS91 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sun3Q5SS91 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sun3Q5SS91 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sun3Q5SS91 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sun3Q5SS91 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Sun3Q5SS91 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sun3Q5SS91 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sun3Q5SS91 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sun3Q5SS91 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sun3Q5SS91 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sun3Q5SS91 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sun3Q5SS91 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sun3Q5SS91 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sun3Q5SS91 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sun3Q5SS91 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sun3Q5SS91 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sun3Q5SS91 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sun3Q5SS91 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sun3Q5SS91 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sun3Q5SS91 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sun3Q5SS91 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Sun3Q5SS91 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sun3Q5SS91 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sun3Q5SS91 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sun3Q5SS91 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sun3Q5SS91 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sun3Q5SS91 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sun3Q5SS91 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sun3Q5SS91 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sun3Q5SS91 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Sun3Q5SS91 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sun3Q5SS91 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sun3Q5SS91 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sun3Q5SS91 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sun3Q5SS91 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sun3Q5SS91 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sun3Q5SS91 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sun3Q5SS91 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sun3Q5SS91 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sun3Q5SS91 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sun3Q5SS91 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sun3Q5SS91 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sun3Q5SS91 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sun3Q5SS91 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Sun3Q5SS91 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sun3Q5SS91 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sun3Q5SS91 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sun3Q5SS91 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sun3Q5SS91 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sun3Q5SS91 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sun3Q5SS91 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sun3Q5SS91 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Sun3Q5SS91 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sun3Q5SS91 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sun3Q5SS91 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sun3Q5SS91 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sun3Q5SS91 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sun3Q5SS91 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sun3Q5SS91 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sun3Q5SS91 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sun3Q5SS91 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sun3Q5SS91 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sun3Q5SS91 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sun3Q5SS91 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sun3Q5SS91 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sun3Q5SS91 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sun3Q5SS91 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sun3Q5SS91 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sun3Q5SS91 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms