Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5730522E02RikQ5SP45 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5730522E02RikQ5SP45 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5730522E02RikQ5SP45 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5730522E02RikQ5SP45 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5730522E02RikQ5SP45 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
5730522E02RikQ5SP45 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
5730522E02RikQ5SP45 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5730522E02RikQ5SP45 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5730522E02RikQ5SP45 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5730522E02RikQ5SP45 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5730522E02RikQ5SP45 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
5730522E02RikQ5SP45 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
5730522E02RikQ5SP45 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5730522E02RikQ5SP45 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
5730522E02RikQ5SP45 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5730522E02RikQ5SP45 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5730522E02RikQ5SP45 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5730522E02RikQ5SP45 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5730522E02RikQ5SP45 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
5730522E02RikQ5SP45 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
5730522E02RikQ5SP45 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5730522E02RikQ5SP45 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5730522E02RikQ5SP45 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
5730522E02RikQ5SP45 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5730522E02RikQ5SP45 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5730522E02RikQ5SP45 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5730522E02RikQ5SP45 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5730522E02RikQ5SP45 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5730522E02RikQ5SP45 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5730522E02RikQ5SP45 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5730522E02RikQ5SP45 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5730522E02RikQ5SP45 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5730522E02RikQ5SP45 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
5730522E02RikQ5SP45 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5730522E02RikQ5SP45 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
5730522E02RikQ5SP45 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
5730522E02RikQ5SP45 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5730522E02RikQ5SP45 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5730522E02RikQ5SP45 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5730522E02RikQ5SP45 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
5730522E02RikQ5SP45 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5730522E02RikQ5SP45 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5730522E02RikQ5SP45 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
5730522E02RikQ5SP45 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
5730522E02RikQ5SP45 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5730522E02RikQ5SP45 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5730522E02RikQ5SP45 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
5730522E02RikQ5SP45 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
5730522E02RikQ5SP45 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5730522E02RikQ5SP45 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5730522E02RikQ5SP45 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5730522E02RikQ5SP45 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5730522E02RikQ5SP45 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5730522E02RikQ5SP45 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
5730522E02RikQ5SP45 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
5730522E02RikQ5SP45 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
5730522E02RikQ5SP45 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
5730522E02RikQ5SP45 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
5730522E02RikQ5SP45 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
5730522E02RikQ5SP45 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
5730522E02RikQ5SP45 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
5730522E02RikQ5SP45 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
5730522E02RikQ5SP45 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
5730522E02RikQ5SP45 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
5730522E02RikQ5SP45 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
5730522E02RikQ5SP45 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms