Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps41Q5KU39 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps41Q5KU39 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps41Q5KU39 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps41Q5KU39 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps41Q5KU39 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps41Q5KU39 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps41Q5KU39 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps41Q5KU39 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps41Q5KU39 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps41Q5KU39 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps41Q5KU39 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps41Q5KU39 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps41Q5KU39 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps41Q5KU39 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps41Q5KU39 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps41Q5KU39 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps41Q5KU39 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps41Q5KU39 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps41Q5KU39 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps41Q5KU39 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps41Q5KU39 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps41Q5KU39 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps41Q5KU39 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps41Q5KU39 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps41Q5KU39 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps41Q5KU39 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps41Q5KU39 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps41Q5KU39 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps41Q5KU39 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps41Q5KU39 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps41Q5KU39 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps41Q5KU39 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps41Q5KU39 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps41Q5KU39 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps41Q5KU39 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps41Q5KU39 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps41Q5KU39 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps41Q5KU39 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps41Q5KU39 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps41Q5KU39 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps41Q5KU39 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps41Q5KU39 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps41Q5KU39 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps41Q5KU39 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Vps41Q5KU39 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vps41Q5KU39 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps41Q5KU39 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps41Q5KU39 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps41Q5KU39 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps41Q5KU39 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps41Q5KU39 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps41Q5KU39 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps41Q5KU39 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps41Q5KU39 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps41Q5KU39 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps41Q5KU39 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps41Q5KU39 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps41Q5KU39 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps41Q5KU39 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps41Q5KU39 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps41Q5KU39 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps41Q5KU39 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps41Q5KU39 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps41Q5KU39 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps41Q5KU39 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps41Q5KU39 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps41Q5KU39 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps41Q5KU39 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps41Q5KU39 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps41Q5KU39 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps41Q5KU39 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps41Q5KU39 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps41Q5KU39 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps41Q5KU39 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps41Q5KU39 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps41Q5KU39 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps41Q5KU39 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms