Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrc3Q5DU56 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrc3Q5DU56 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc3Q5DU56 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc3Q5DU56 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc3Q5DU56 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrc3Q5DU56 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrc3Q5DU56 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc3Q5DU56 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc3Q5DU56 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc3Q5DU56 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrc3Q5DU56 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrc3Q5DU56 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrc3Q5DU56 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc3Q5DU56 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrc3Q5DU56 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrc3Q5DU56 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc3Q5DU56 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc3Q5DU56 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrc3Q5DU56 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrc3Q5DU56 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrc3Q5DU56 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrc3Q5DU56 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrc3Q5DU56 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrc3Q5DU56 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrc3Q5DU56 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nlrc3Q5DU56 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrc3Q5DU56 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc3Q5DU56 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc3Q5DU56 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc3Q5DU56 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc3Q5DU56 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrc3Q5DU56 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrc3Q5DU56 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc3Q5DU56 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc3Q5DU56 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc3Q5DU56 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrc3Q5DU56 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrc3Q5DU56 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrc3Q5DU56 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrc3Q5DU56 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrc3Q5DU56 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrc3Q5DU56 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrc3Q5DU56 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc3Q5DU56 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc3Q5DU56 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc3Q5DU56 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc3Q5DU56 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc3Q5DU56 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc3Q5DU56 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc3Q5DU56 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrc3Q5DU56 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrc3Q5DU56 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrc3Q5DU56 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrc3Q5DU56 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrc3Q5DU56 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrc3Q5DU56 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrc3Q5DU56 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrc3Q5DU56 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrc3Q5DU56 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrc3Q5DU56 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrc3Q5DU56 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrc3Q5DU56 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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