Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Afap1l2Q5DTU0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Afap1l2Q5DTU0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Afap1l2Q5DTU0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Afap1l2Q5DTU0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Afap1l2Q5DTU0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Afap1l2Q5DTU0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Afap1l2Q5DTU0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Afap1l2Q5DTU0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Afap1l2Q5DTU0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Afap1l2Q5DTU0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Afap1l2Q5DTU0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Afap1l2Q5DTU0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Afap1l2Q5DTU0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Afap1l2Q5DTU0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Afap1l2Q5DTU0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Afap1l2Q5DTU0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms