Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chsy3Q5DTK1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Chsy3Q5DTK1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Chsy3Q5DTK1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chsy3Q5DTK1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chsy3Q5DTK1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chsy3Q5DTK1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chsy3Q5DTK1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chsy3Q5DTK1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chsy3Q5DTK1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chsy3Q5DTK1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chsy3Q5DTK1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chsy3Q5DTK1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chsy3Q5DTK1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chsy3Q5DTK1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chsy3Q5DTK1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chsy3Q5DTK1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chsy3Q5DTK1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chsy3Q5DTK1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chsy3Q5DTK1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chsy3Q5DTK1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chsy3Q5DTK1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chsy3Q5DTK1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chsy3Q5DTK1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chsy3Q5DTK1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chsy3Q5DTK1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chsy3Q5DTK1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chsy3Q5DTK1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chsy3Q5DTK1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chsy3Q5DTK1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chsy3Q5DTK1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Chsy3Q5DTK1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chsy3Q5DTK1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chsy3Q5DTK1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chsy3Q5DTK1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Chsy3Q5DTK1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chsy3Q5DTK1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chsy3Q5DTK1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chsy3Q5DTK1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chsy3Q5DTK1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chsy3Q5DTK1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chsy3Q5DTK1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chsy3Q5DTK1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chsy3Q5DTK1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chsy3Q5DTK1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chsy3Q5DTK1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chsy3Q5DTK1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chsy3Q5DTK1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chsy3Q5DTK1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chsy3Q5DTK1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chsy3Q5DTK1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chsy3Q5DTK1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chsy3Q5DTK1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Chsy3Q5DTK1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chsy3Q5DTK1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chsy3Q5DTK1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chsy3Q5DTK1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chsy3Q5DTK1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chsy3Q5DTK1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chsy3Q5DTK1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chsy3Q5DTK1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chsy3Q5DTK1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chsy3Q5DTK1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chsy3Q5DTK1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chsy3Q5DTK1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chsy3Q5DTK1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chsy3Q5DTK1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chsy3Q5DTK1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chsy3Q5DTK1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chsy3Q5DTK1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chsy3Q5DTK1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chsy3Q5DTK1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chsy3Q5DTK1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chsy3Q5DTK1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chsy3Q5DTK1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chsy3Q5DTK1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chsy3Q5DTK1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms