Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phactr4Q501J7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phactr4Q501J7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Phactr4Q501J7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Phactr4Q501J7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phactr4Q501J7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phactr4Q501J7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phactr4Q501J7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phactr4Q501J7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phactr4Q501J7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phactr4Q501J7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phactr4Q501J7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phactr4Q501J7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phactr4Q501J7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phactr4Q501J7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phactr4Q501J7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phactr4Q501J7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phactr4Q501J7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phactr4Q501J7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phactr4Q501J7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phactr4Q501J7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phactr4Q501J7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phactr4Q501J7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Phactr4Q501J7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Phactr4Q501J7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phactr4Q501J7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phactr4Q501J7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Phactr4Q501J7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phactr4Q501J7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Phactr4Q501J7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phactr4Q501J7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phactr4Q501J7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phactr4Q501J7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phactr4Q501J7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phactr4Q501J7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phactr4Q501J7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phactr4Q501J7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Phactr4Q501J7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Phactr4Q501J7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Phactr4Q501J7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Phactr4Q501J7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phactr4Q501J7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phactr4Q501J7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phactr4Q501J7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Phactr4Q501J7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Phactr4Q501J7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phactr4Q501J7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phactr4Q501J7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phactr4Q501J7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phactr4Q501J7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phactr4Q501J7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phactr4Q501J7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phactr4Q501J7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phactr4Q501J7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phactr4Q501J7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phactr4Q501J7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phactr4Q501J7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phactr4Q501J7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phactr4Q501J7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phactr4Q501J7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phactr4Q501J7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phactr4Q501J7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phactr4Q501J7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phactr4Q501J7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phactr4Q501J7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phactr4Q501J7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phactr4Q501J7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms