Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Brinp3Q499E0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Brinp3Q499E0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Brinp3Q499E0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Brinp3Q499E0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Brinp3Q499E0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Brinp3Q499E0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Brinp3Q499E0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Brinp3Q499E0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Brinp3Q499E0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Brinp3Q499E0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Brinp3Q499E0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Brinp3Q499E0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Brinp3Q499E0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Brinp3Q499E0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Brinp3Q499E0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Brinp3Q499E0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Brinp3Q499E0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Brinp3Q499E0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Brinp3Q499E0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Brinp3Q499E0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Brinp3Q499E0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Brinp3Q499E0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Brinp3Q499E0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Brinp3Q499E0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Brinp3Q499E0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Brinp3Q499E0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Brinp3Q499E0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Brinp3Q499E0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Brinp3Q499E0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Brinp3Q499E0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Brinp3Q499E0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Brinp3Q499E0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Brinp3Q499E0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Brinp3Q499E0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Brinp3Q499E0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Brinp3Q499E0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Brinp3Q499E0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Brinp3Q499E0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Brinp3Q499E0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Brinp3Q499E0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Brinp3Q499E0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Brinp3Q499E0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Brinp3Q499E0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Brinp3Q499E0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Brinp3Q499E0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Brinp3Q499E0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Brinp3Q499E0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Brinp3Q499E0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Brinp3Q499E0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Brinp3Q499E0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Brinp3Q499E0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Brinp3Q499E0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Brinp3Q499E0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Brinp3Q499E0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Brinp3Q499E0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Brinp3Q499E0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Brinp3Q499E0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Brinp3Q499E0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Brinp3Q499E0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Brinp3Q499E0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Brinp3Q499E0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Brinp3Q499E0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Brinp3Q499E0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Brinp3Q499E0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Brinp3Q499E0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Brinp3Q499E0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Brinp3Q499E0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Brinp3Q499E0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Brinp3Q499E0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Brinp3Q499E0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Brinp3Q499E0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Brinp3Q499E0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Brinp3Q499E0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Brinp3Q499E0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Brinp3Q499E0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Brinp3Q499E0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Brinp3Q499E0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Brinp3Q499E0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Brinp3Q499E0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Brinp3Q499E0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Brinp3Q499E0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Brinp3Q499E0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Brinp3Q499E0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Brinp3Q499E0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Brinp3Q499E0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Brinp3Q499E0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Brinp3Q499E0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Brinp3Q499E0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Brinp3Q499E0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Brinp3Q499E0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Brinp3Q499E0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Brinp3Q499E0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Brinp3Q499E0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Brinp3Q499E0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Brinp3Q499E0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Brinp3Q499E0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Brinp3Q499E0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Brinp3Q499E0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Brinp3Q499E0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms