Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2al1nQ497L1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2al1nQ497L1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2al1nQ497L1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1nQ497L1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1nQ497L1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1nQ497L1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1nQ497L1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2al1nQ497L1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2al1nQ497L1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2al1nQ497L1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2al1nQ497L1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2al1nQ497L1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2al1nQ497L1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2al1nQ497L1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2al1nQ497L1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2al1nQ497L1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2al1nQ497L1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2al1nQ497L1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2al1nQ497L1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2al1nQ497L1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2al1nQ497L1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al1nQ497L1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2al1nQ497L1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms