Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms