Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0W9

4930432M17Rik, RIKEN cDNA 4930432M17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930432M17RikQ3V0W9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930432M17RikQ3V0W9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930432M17RikQ3V0W9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930432M17RikQ3V0W9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930432M17RikQ3V0W9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930432M17RikQ3V0W9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930432M17RikQ3V0W9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930432M17RikQ3V0W9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930432M17RikQ3V0W9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930432M17RikQ3V0W9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4930432M17RikQ3V0W9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
4930432M17RikQ3V0W9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930432M17RikQ3V0W9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930432M17RikQ3V0W9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930432M17RikQ3V0W9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930432M17RikQ3V0W9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930432M17RikQ3V0W9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930432M17RikQ3V0W9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930432M17RikQ3V0W9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930432M17RikQ3V0W9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930432M17RikQ3V0W9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930432M17RikQ3V0W9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930432M17RikQ3V0W9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930432M17RikQ3V0W9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930432M17RikQ3V0W9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
4930432M17RikQ3V0W9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms