Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bbof1Q3V079 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bbof1Q3V079 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Bbof1Q3V079 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bbof1Q3V079 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Bbof1Q3V079 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bbof1Q3V079 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bbof1Q3V079 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Bbof1Q3V079 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bbof1Q3V079 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bbof1Q3V079 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bbof1Q3V079 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bbof1Q3V079 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bbof1Q3V079 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bbof1Q3V079 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bbof1Q3V079 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bbof1Q3V079 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bbof1Q3V079 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bbof1Q3V079 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bbof1Q3V079 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bbof1Q3V079 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bbof1Q3V079 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Bbof1Q3V079 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bbof1Q3V079 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bbof1Q3V079 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bbof1Q3V079 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bbof1Q3V079 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bbof1Q3V079 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bbof1Q3V079 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Bbof1Q3V079 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Bbof1Q3V079 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bbof1Q3V079 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bbof1Q3V079 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bbof1Q3V079 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Bbof1Q3V079 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Bbof1Q3V079 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bbof1Q3V079 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bbof1Q3V079 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bbof1Q3V079 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bbof1Q3V079 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bbof1Q3V079 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bbof1Q3V079 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bbof1Q3V079 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bbof1Q3V079 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bbof1Q3V079 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Bbof1Q3V079 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Bbof1Q3V079 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms