Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UZV7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UZV7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UZV7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UZV7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UZV7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UZV7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UZV7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3UZV7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3UZV7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3UZV7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UZV7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UZV7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UZV7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3UZV7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3UZV7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3UZV7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3UZV7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3UZV7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3UZV7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3UZV7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3UZV7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3UZV7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3UZV7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UZV7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UZV7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UZV7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3UZV7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3UZV7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3UZV7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3UZV7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3UZV7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3UZV7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3UZV7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3UZV7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3UZV7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UZV7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UZV7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3UZV7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3UZV7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3UZV7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UZV7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UZV7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UZV7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3UZV7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3UZV7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3UZV7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3UZV7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3UZV7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3UZV7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3UZV7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3UZV7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3UZV7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3UZV7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UZV7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UZV7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UZV7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UZV7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UZV7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UZV7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UZV7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UZV7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3UZV7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UZV7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UZV7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3UZV7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UZV7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UZV7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UZV7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UZV7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UZV7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UZV7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UZV7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UZV7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3UZV7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3UZV7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UZV7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UZV7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UZV7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3UZV7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3UZV7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3UZV7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3UZV7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms