Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrc55Q3UY51 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrc55Q3UY51 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc55Q3UY51 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lrrc55Q3UY51 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrrc55Q3UY51 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrrc55Q3UY51 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrc55Q3UY51 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrc55Q3UY51 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrc55Q3UY51 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrrc55Q3UY51 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrrc55Q3UY51 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc55Q3UY51 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrrc55Q3UY51 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrrc55Q3UY51 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lrrc55Q3UY51 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrc55Q3UY51 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrc55Q3UY51 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrc55Q3UY51 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrrc55Q3UY51 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrc55Q3UY51 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrc55Q3UY51 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrc55Q3UY51 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrrc55Q3UY51 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrrc55Q3UY51 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrrc55Q3UY51 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrrc55Q3UY51 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrc55Q3UY51 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrrc55Q3UY51 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrrc55Q3UY51 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrrc55Q3UY51 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrrc55Q3UY51 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrrc55Q3UY51 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrrc55Q3UY51 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrrc55Q3UY51 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrrc55Q3UY51 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrrc55Q3UY51 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrrc55Q3UY51 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrrc55Q3UY51 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrrc55Q3UY51 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrrc55Q3UY51 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrrc55Q3UY51 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrrc55Q3UY51 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrrc55Q3UY51 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrrc55Q3UY51 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrrc55Q3UY51 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrrc55Q3UY51 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrrc55Q3UY51 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrc55Q3UY51 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrc55Q3UY51 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrc55Q3UY51 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc55Q3UY51 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc55Q3UY51 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc55Q3UY51 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc55Q3UY51 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc55Q3UY51 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc55Q3UY51 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc55Q3UY51 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc55Q3UY51 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc55Q3UY51 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrrc55Q3UY51 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrrc55Q3UY51 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc55Q3UY51 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc55Q3UY51 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc55Q3UY51 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc55Q3UY51 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrc55Q3UY51 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc55Q3UY51 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc55Q3UY51 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc55Q3UY51 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Lrrc55Q3UY51 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc55Q3UY51 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc55Q3UY51 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc55Q3UY51 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc55Q3UY51 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc55Q3UY51 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc55Q3UY51 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc55Q3UY51 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc55Q3UY51 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc55Q3UY51 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrc55Q3UY51 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc55Q3UY51 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc55Q3UY51 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc55Q3UY51 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc55Q3UY51 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc55Q3UY51 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc55Q3UY51 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc55Q3UY51 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrc55Q3UY51 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrc55Q3UY51 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lrrc55Q3UY51 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrrc55Q3UY51 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrrc55Q3UY51 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrrc55Q3UY51 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc55Q3UY51 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc55Q3UY51 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc55Q3UY51 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc55Q3UY51 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrc55Q3UY51 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrc55Q3UY51 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms