Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pfdn4Q3UWL8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pfdn4Q3UWL8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pfdn4Q3UWL8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pfdn4Q3UWL8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pfdn4Q3UWL8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pfdn4Q3UWL8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pfdn4Q3UWL8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pfdn4Q3UWL8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pfdn4Q3UWL8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pfdn4Q3UWL8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pfdn4Q3UWL8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pfdn4Q3UWL8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pfdn4Q3UWL8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pfdn4Q3UWL8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pfdn4Q3UWL8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pfdn4Q3UWL8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pfdn4Q3UWL8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pfdn4Q3UWL8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pfdn4Q3UWL8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pfdn4Q3UWL8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pfdn4Q3UWL8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pfdn4Q3UWL8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pfdn4Q3UWL8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pfdn4Q3UWL8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pfdn4Q3UWL8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pfdn4Q3UWL8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pfdn4Q3UWL8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pfdn4Q3UWL8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pfdn4Q3UWL8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pfdn4Q3UWL8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pfdn4Q3UWL8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pfdn4Q3UWL8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pfdn4Q3UWL8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pfdn4Q3UWL8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pfdn4Q3UWL8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pfdn4Q3UWL8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pfdn4Q3UWL8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pfdn4Q3UWL8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pfdn4Q3UWL8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pfdn4Q3UWL8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pfdn4Q3UWL8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pfdn4Q3UWL8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pfdn4Q3UWL8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pfdn4Q3UWL8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pfdn4Q3UWL8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pfdn4Q3UWL8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pfdn4Q3UWL8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pfdn4Q3UWL8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pfdn4Q3UWL8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pfdn4Q3UWL8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pfdn4Q3UWL8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pfdn4Q3UWL8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pfdn4Q3UWL8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pfdn4Q3UWL8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pfdn4Q3UWL8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pfdn4Q3UWL8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pfdn4Q3UWL8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pfdn4Q3UWL8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pfdn4Q3UWL8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pfdn4Q3UWL8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pfdn4Q3UWL8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms