Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
D130052B06RikQ3UW13 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
D130052B06RikQ3UW13 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
D130052B06RikQ3UW13 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
D130052B06RikQ3UW13 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
D130052B06RikQ3UW13 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
D130052B06RikQ3UW13 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
D130052B06RikQ3UW13 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
D130052B06RikQ3UW13 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
D130052B06RikQ3UW13 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
D130052B06RikQ3UW13 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
D130052B06RikQ3UW13 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
D130052B06RikQ3UW13 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
D130052B06RikQ3UW13 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
D130052B06RikQ3UW13 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms