Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx21Q3UR97 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx21Q3UR97 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx21Q3UR97 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx21Q3UR97 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx21Q3UR97 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx21Q3UR97 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx21Q3UR97 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx21Q3UR97 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx21Q3UR97 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx21Q3UR97 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx21Q3UR97 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx21Q3UR97 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx21Q3UR97 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx21Q3UR97 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx21Q3UR97 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx21Q3UR97 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx21Q3UR97 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx21Q3UR97 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx21Q3UR97 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx21Q3UR97 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx21Q3UR97 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx21Q3UR97 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx21Q3UR97 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx21Q3UR97 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx21Q3UR97 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx21Q3UR97 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx21Q3UR97 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx21Q3UR97 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx21Q3UR97 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx21Q3UR97 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx21Q3UR97 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx21Q3UR97 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx21Q3UR97 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx21Q3UR97 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx21Q3UR97 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx21Q3UR97 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx21Q3UR97 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx21Q3UR97 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx21Q3UR97 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx21Q3UR97 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx21Q3UR97 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx21Q3UR97 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx21Q3UR97 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx21Q3UR97 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx21Q3UR97 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx21Q3UR97 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx21Q3UR97 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx21Q3UR97 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx21Q3UR97 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx21Q3UR97 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx21Q3UR97 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx21Q3UR97 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx21Q3UR97 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx21Q3UR97 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx21Q3UR97 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx21Q3UR97 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx21Q3UR97 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx21Q3UR97 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx21Q3UR97 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx21Q3UR97 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx21Q3UR97 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx21Q3UR97 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx21Q3UR97 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx21Q3UR97 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx21Q3UR97 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx21Q3UR97 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx21Q3UR97 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx21Q3UR97 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx21Q3UR97 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx21Q3UR97 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx21Q3UR97 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx21Q3UR97 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx21Q3UR97 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx21Q3UR97 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx21Q3UR97 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx21Q3UR97 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx21Q3UR97 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx21Q3UR97 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx21Q3UR97 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx21Q3UR97 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx21Q3UR97 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx21Q3UR97 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx21Q3UR97 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms