Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cln5Q3UMW8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cln5Q3UMW8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cln5Q3UMW8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cln5Q3UMW8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cln5Q3UMW8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cln5Q3UMW8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cln5Q3UMW8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cln5Q3UMW8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cln5Q3UMW8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cln5Q3UMW8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cln5Q3UMW8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cln5Q3UMW8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln5Q3UMW8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln5Q3UMW8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln5Q3UMW8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln5Q3UMW8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln5Q3UMW8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cln5Q3UMW8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cln5Q3UMW8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln5Q3UMW8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln5Q3UMW8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln5Q3UMW8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln5Q3UMW8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cln5Q3UMW8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cln5Q3UMW8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cln5Q3UMW8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cln5Q3UMW8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cln5Q3UMW8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cln5Q3UMW8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cln5Q3UMW8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cln5Q3UMW8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cln5Q3UMW8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln5Q3UMW8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln5Q3UMW8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln5Q3UMW8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln5Q3UMW8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cln5Q3UMW8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cln5Q3UMW8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cln5Q3UMW8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cln5Q3UMW8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cln5Q3UMW8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cln5Q3UMW8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cln5Q3UMW8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cln5Q3UMW8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cln5Q3UMW8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cln5Q3UMW8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cln5Q3UMW8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cln5Q3UMW8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cln5Q3UMW8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cln5Q3UMW8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cln5Q3UMW8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cln5Q3UMW8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cln5Q3UMW8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cln5Q3UMW8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cln5Q3UMW8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cln5Q3UMW8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cln5Q3UMW8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cln5Q3UMW8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cln5Q3UMW8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cln5Q3UMW8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cln5Q3UMW8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cln5Q3UMW8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cln5Q3UMW8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cln5Q3UMW8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cln5Q3UMW8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cln5Q3UMW8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cln5Q3UMW8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cln5Q3UMW8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cln5Q3UMW8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cln5Q3UMW8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cln5Q3UMW8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cln5Q3UMW8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cln5Q3UMW8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cln5Q3UMW8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cln5Q3UMW8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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