Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cobll1Q3UMF0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cobll1Q3UMF0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cobll1Q3UMF0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cobll1Q3UMF0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cobll1Q3UMF0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cobll1Q3UMF0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cobll1Q3UMF0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cobll1Q3UMF0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cobll1Q3UMF0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cobll1Q3UMF0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cobll1Q3UMF0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cobll1Q3UMF0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cobll1Q3UMF0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cobll1Q3UMF0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cobll1Q3UMF0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cobll1Q3UMF0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cobll1Q3UMF0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cobll1Q3UMF0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cobll1Q3UMF0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cobll1Q3UMF0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cobll1Q3UMF0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cobll1Q3UMF0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cobll1Q3UMF0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cobll1Q3UMF0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cobll1Q3UMF0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cobll1Q3UMF0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cobll1Q3UMF0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cobll1Q3UMF0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cobll1Q3UMF0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cobll1Q3UMF0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cobll1Q3UMF0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cobll1Q3UMF0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cobll1Q3UMF0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cobll1Q3UMF0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cobll1Q3UMF0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cobll1Q3UMF0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cobll1Q3UMF0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cobll1Q3UMF0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cobll1Q3UMF0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cobll1Q3UMF0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cobll1Q3UMF0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cobll1Q3UMF0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cobll1Q3UMF0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cobll1Q3UMF0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cobll1Q3UMF0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cobll1Q3UMF0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cobll1Q3UMF0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cobll1Q3UMF0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cobll1Q3UMF0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cobll1Q3UMF0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cobll1Q3UMF0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cobll1Q3UMF0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cobll1Q3UMF0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cobll1Q3UMF0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cobll1Q3UMF0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cobll1Q3UMF0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cobll1Q3UMF0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cobll1Q3UMF0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cobll1Q3UMF0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cobll1Q3UMF0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms