Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem241Q3UME2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem241Q3UME2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem241Q3UME2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem241Q3UME2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem241Q3UME2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem241Q3UME2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem241Q3UME2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem241Q3UME2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem241Q3UME2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem241Q3UME2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem241Q3UME2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem241Q3UME2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem241Q3UME2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem241Q3UME2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem241Q3UME2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem241Q3UME2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem241Q3UME2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem241Q3UME2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem241Q3UME2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem241Q3UME2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem241Q3UME2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem241Q3UME2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem241Q3UME2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem241Q3UME2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem241Q3UME2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem241Q3UME2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem241Q3UME2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem241Q3UME2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem241Q3UME2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem241Q3UME2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem241Q3UME2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem241Q3UME2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem241Q3UME2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem241Q3UME2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem241Q3UME2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem241Q3UME2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem241Q3UME2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem241Q3UME2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem241Q3UME2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem241Q3UME2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms