Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Usp19Q3UJD6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Usp19Q3UJD6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Usp19Q3UJD6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Usp19Q3UJD6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Usp19Q3UJD6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Usp19Q3UJD6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Usp19Q3UJD6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Usp19Q3UJD6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Usp19Q3UJD6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Usp19Q3UJD6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Usp19Q3UJD6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Usp19Q3UJD6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Usp19Q3UJD6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Usp19Q3UJD6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Usp19Q3UJD6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Usp19Q3UJD6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Usp19Q3UJD6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Usp19Q3UJD6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Usp19Q3UJD6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Usp19Q3UJD6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Usp19Q3UJD6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Usp19Q3UJD6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Usp19Q3UJD6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Usp19Q3UJD6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Usp19Q3UJD6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Usp19Q3UJD6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Usp19Q3UJD6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Usp19Q3UJD6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Usp19Q3UJD6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Usp19Q3UJD6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Usp19Q3UJD6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Usp19Q3UJD6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Usp19Q3UJD6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Usp19Q3UJD6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Usp19Q3UJD6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Usp19Q3UJD6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Usp19Q3UJD6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Usp19Q3UJD6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Usp19Q3UJD6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Usp19Q3UJD6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Usp19Q3UJD6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Usp19Q3UJD6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Usp19Q3UJD6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Usp19Q3UJD6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Usp19Q3UJD6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Usp19Q3UJD6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Usp19Q3UJD6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Usp19Q3UJD6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Usp19Q3UJD6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Usp19Q3UJD6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Usp19Q3UJD6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Usp19Q3UJD6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Usp19Q3UJD6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Usp19Q3UJD6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Usp19Q3UJD6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Usp19Q3UJD6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Usp19Q3UJD6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Usp19Q3UJD6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Usp19Q3UJD6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Usp19Q3UJD6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Usp19Q3UJD6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Usp19Q3UJD6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Usp19Q3UJD6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Usp19Q3UJD6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Usp19Q3UJD6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Usp19Q3UJD6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Usp19Q3UJD6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Usp19Q3UJD6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Usp19Q3UJD6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Usp19Q3UJD6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Usp19Q3UJD6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Usp19Q3UJD6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Usp19Q3UJD6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Usp19Q3UJD6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Usp19Q3UJD6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Usp19Q3UJD6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Usp19Q3UJD6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Usp19Q3UJD6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Usp19Q3UJD6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Usp19Q3UJD6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Usp19Q3UJD6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Usp19Q3UJD6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Usp19Q3UJD6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Usp19Q3UJD6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Usp19Q3UJD6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Usp19Q3UJD6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Usp19Q3UJD6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Usp19Q3UJD6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Usp19Q3UJD6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Usp19Q3UJD6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Usp19Q3UJD6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Usp19Q3UJD6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Usp19Q3UJD6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Usp19Q3UJD6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Usp19Q3UJD6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Usp19Q3UJD6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Usp19Q3UJD6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Usp19Q3UJD6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Usp19Q3UJD6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms