Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Zyg11bQ3UFS0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zyg11bQ3UFS0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zyg11bQ3UFS0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zyg11bQ3UFS0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zyg11bQ3UFS0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zyg11bQ3UFS0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zyg11bQ3UFS0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zyg11bQ3UFS0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zyg11bQ3UFS0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zyg11bQ3UFS0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zyg11bQ3UFS0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zyg11bQ3UFS0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zyg11bQ3UFS0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Zyg11bQ3UFS0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zyg11bQ3UFS0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zyg11bQ3UFS0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zyg11bQ3UFS0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zyg11bQ3UFS0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zyg11bQ3UFS0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zyg11bQ3UFS0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zyg11bQ3UFS0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zyg11bQ3UFS0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zyg11bQ3UFS0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zyg11bQ3UFS0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zyg11bQ3UFS0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zyg11bQ3UFS0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zyg11bQ3UFS0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zyg11bQ3UFS0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zyg11bQ3UFS0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zyg11bQ3UFS0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Zyg11bQ3UFS0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zyg11bQ3UFS0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zyg11bQ3UFS0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zyg11bQ3UFS0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zyg11bQ3UFS0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zyg11bQ3UFS0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zyg11bQ3UFS0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zyg11bQ3UFS0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zyg11bQ3UFS0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zyg11bQ3UFS0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zyg11bQ3UFS0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zyg11bQ3UFS0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zyg11bQ3UFS0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zyg11bQ3UFS0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zyg11bQ3UFS0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zyg11bQ3UFS0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zyg11bQ3UFS0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zyg11bQ3UFS0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zyg11bQ3UFS0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zyg11bQ3UFS0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zyg11bQ3UFS0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zyg11bQ3UFS0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zyg11bQ3UFS0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zyg11bQ3UFS0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zyg11bQ3UFS0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zyg11bQ3UFS0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zyg11bQ3UFS0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zyg11bQ3UFS0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zyg11bQ3UFS0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zyg11bQ3UFS0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zyg11bQ3UFS0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zyg11bQ3UFS0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zyg11bQ3UFS0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zyg11bQ3UFS0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zyg11bQ3UFS0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms