Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hectd3Q3U487 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hectd3Q3U487 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hectd3Q3U487 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hectd3Q3U487 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hectd3Q3U487 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hectd3Q3U487 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hectd3Q3U487 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hectd3Q3U487 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hectd3Q3U487 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hectd3Q3U487 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hectd3Q3U487 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hectd3Q3U487 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hectd3Q3U487 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hectd3Q3U487 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hectd3Q3U487 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hectd3Q3U487 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hectd3Q3U487 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hectd3Q3U487 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hectd3Q3U487 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hectd3Q3U487 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hectd3Q3U487 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hectd3Q3U487 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hectd3Q3U487 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hectd3Q3U487 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hectd3Q3U487 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hectd3Q3U487 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hectd3Q3U487 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hectd3Q3U487 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hectd3Q3U487 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms