Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Vars2Q3U2A8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32,52■■■□□ 2,8
Vars2Q3U2A8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Vars2Q3U2A8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Vars2Q3U2A8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Vars2Q3U2A8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Vars2Q3U2A8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32,49■■■□□ 2,79
Vars2Q3U2A8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Vars2Q3U2A8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Vars2Q3U2A8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Vars2Q3U2A8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Vars2Q3U2A8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Vars2Q3U2A8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Vars2Q3U2A8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Vars2Q3U2A8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,41■■■□□ 2,78
Vars2Q3U2A8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Vars2Q3U2A8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,38■■■□□ 2,77
Vars2Q3U2A8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Vars2Q3U2A8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Vars2Q3U2A8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Vars2Q3U2A8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Vars2Q3U2A8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Vars2Q3U2A8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Vars2Q3U2A8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,77
Vars2Q3U2A8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Vars2Q3U2A8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Vars2Q3U2A8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,3■■■□□ 2,76
Vars2Q3U2A8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32,3■■■□□ 2,76
Vars2Q3U2A8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Vars2Q3U2A8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Vars2Q3U2A8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Vars2Q3U2A8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Vars2Q3U2A8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32,26■■■□□ 2,75
Vars2Q3U2A8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Vars2Q3U2A8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32,24■■■□□ 2,75
Vars2Q3U2A8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Vars2Q3U2A8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Vars2Q3U2A8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Vars2Q3U2A8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,22■■■□□ 2,75
Vars2Q3U2A8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Vars2Q3U2A8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Vars2Q3U2A8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Vars2Q3U2A8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Vars2Q3U2A8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Vars2Q3U2A8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Vars2Q3U2A8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Vars2Q3U2A8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Vars2Q3U2A8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Vars2Q3U2A8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Vars2Q3U2A8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32,16■■■□□ 2,74
Vars2Q3U2A8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Vars2Q3U2A8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Vars2Q3U2A8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Vars2Q3U2A8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Vars2Q3U2A8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Vars2Q3U2A8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Vars2Q3U2A8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Vars2Q3U2A8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Vars2Q3U2A8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32,09■■■□□ 2,73
Vars2Q3U2A8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Vars2Q3U2A8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32,07■■■□□ 2,72
Vars2Q3U2A8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Vars2Q3U2A8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Vars2Q3U2A8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Vars2Q3U2A8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32,05■■■□□ 2,72
Vars2Q3U2A8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Vars2Q3U2A8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Vars2Q3U2A8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Vars2Q3U2A8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Vars2Q3U2A8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32,02■■■□□ 2,72
Vars2Q3U2A8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Vars2Q3U2A8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Vars2Q3U2A8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Vars2Q3U2A8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Vars2Q3U2A8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Vars2Q3U2A8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Vars2Q3U2A8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31,97■■■□□ 2,71
Vars2Q3U2A8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31,96■■■□□ 2,71
Vars2Q3U2A8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Vars2Q3U2A8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31,94■■■□□ 2,7
Vars2Q3U2A8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Vars2Q3U2A8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Vars2Q3U2A8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Vars2Q3U2A8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,92■■■□□ 2,7
Vars2Q3U2A8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC31,92■■■□□ 2,7
Vars2Q3U2A8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Vars2Q3U2A8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31,9■■■□□ 2,7
Vars2Q3U2A8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Vars2Q3U2A8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC31,88■■■□□ 2,69
Vars2Q3U2A8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Vars2Q3U2A8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,86■■■□□ 2,69
Vars2Q3U2A8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Vars2Q3U2A8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Vars2Q3U2A8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Vars2Q3U2A8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31,86■■■□□ 2,69
Vars2Q3U2A8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Vars2Q3U2A8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Vars2Q3U2A8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC31,85■■■□□ 2,69
Vars2Q3U2A8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Vars2Q3U2A8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,8 ms