Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C4

Secisbp2, MCG1271, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Secisbp2Q3U1C4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Secisbp2Q3U1C4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Secisbp2Q3U1C4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Secisbp2Q3U1C4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Secisbp2Q3U1C4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Secisbp2Q3U1C4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Secisbp2Q3U1C4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Secisbp2Q3U1C4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Secisbp2Q3U1C4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Secisbp2Q3U1C4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Secisbp2Q3U1C4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Secisbp2Q3U1C4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Secisbp2Q3U1C4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Secisbp2Q3U1C4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Secisbp2Q3U1C4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Secisbp2Q3U1C4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Secisbp2Q3U1C4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Secisbp2Q3U1C4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Secisbp2Q3U1C4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Secisbp2Q3U1C4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Secisbp2Q3U1C4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Secisbp2Q3U1C4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Secisbp2Q3U1C4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Secisbp2Q3U1C4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Secisbp2Q3U1C4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Secisbp2Q3U1C4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Secisbp2Q3U1C4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Secisbp2Q3U1C4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Secisbp2Q3U1C4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Secisbp2Q3U1C4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Secisbp2Q3U1C4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Secisbp2Q3U1C4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Secisbp2Q3U1C4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Secisbp2Q3U1C4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Secisbp2Q3U1C4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Secisbp2Q3U1C4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Secisbp2Q3U1C4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Secisbp2Q3U1C4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Secisbp2Q3U1C4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Secisbp2Q3U1C4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Secisbp2Q3U1C4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Secisbp2Q3U1C4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms