Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZ89

Sec31b, Protein transport protein Sec31B, mousemouse

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31bQ3TZ89 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sec31bQ3TZ89 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sec31bQ3TZ89 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sec31bQ3TZ89 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sec31bQ3TZ89 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sec31bQ3TZ89 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sec31bQ3TZ89 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec31bQ3TZ89 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec31bQ3TZ89 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec31bQ3TZ89 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec31bQ3TZ89 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec31bQ3TZ89 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec31bQ3TZ89 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sec31bQ3TZ89 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sec31bQ3TZ89 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sec31bQ3TZ89 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sec31bQ3TZ89 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sec31bQ3TZ89 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec31bQ3TZ89 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec31bQ3TZ89 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec31bQ3TZ89 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec31bQ3TZ89 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sec31bQ3TZ89 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sec31bQ3TZ89 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sec31bQ3TZ89 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sec31bQ3TZ89 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sec31bQ3TZ89 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sec31bQ3TZ89 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sec31bQ3TZ89 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sec31bQ3TZ89 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sec31bQ3TZ89 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sec31bQ3TZ89 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec31bQ3TZ89 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec31bQ3TZ89 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec31bQ3TZ89 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sec31bQ3TZ89 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sec31bQ3TZ89 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec31bQ3TZ89 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sec31bQ3TZ89 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sec31bQ3TZ89 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sec31bQ3TZ89 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sec31bQ3TZ89 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sec31bQ3TZ89 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sec31bQ3TZ89 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sec31bQ3TZ89 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sec31bQ3TZ89 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sec31bQ3TZ89 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sec31bQ3TZ89 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sec31bQ3TZ89 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec31bQ3TZ89 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec31bQ3TZ89 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec31bQ3TZ89 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sec31bQ3TZ89 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec31bQ3TZ89 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sec31bQ3TZ89 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sec31bQ3TZ89 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec31bQ3TZ89 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sec31bQ3TZ89 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sec31bQ3TZ89 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sec31bQ3TZ89 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sec31bQ3TZ89 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sec31bQ3TZ89 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sec31bQ3TZ89 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec31bQ3TZ89 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec31bQ3TZ89 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sec31bQ3TZ89 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sec31bQ3TZ89 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec31bQ3TZ89 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec31bQ3TZ89 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec31bQ3TZ89 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sec31bQ3TZ89 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sec31bQ3TZ89 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec31bQ3TZ89 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec31bQ3TZ89 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec31bQ3TZ89 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec31bQ3TZ89 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec31bQ3TZ89 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sec31bQ3TZ89 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec31bQ3TZ89 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec31bQ3TZ89 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec31bQ3TZ89 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec31bQ3TZ89 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sec31bQ3TZ89 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms