Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ctdnep1Q3TP92 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ctdnep1Q3TP92 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ctdnep1Q3TP92 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ctdnep1Q3TP92 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ctdnep1Q3TP92 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ctdnep1Q3TP92 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ctdnep1Q3TP92 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ctdnep1Q3TP92 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ctdnep1Q3TP92 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ctdnep1Q3TP92 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Ctdnep1Q3TP92 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ctdnep1Q3TP92 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ctdnep1Q3TP92 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ctdnep1Q3TP92 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ctdnep1Q3TP92 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ctdnep1Q3TP92 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ctdnep1Q3TP92 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ctdnep1Q3TP92 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ctdnep1Q3TP92 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ctdnep1Q3TP92 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ctdnep1Q3TP92 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ctdnep1Q3TP92 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ctdnep1Q3TP92 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ctdnep1Q3TP92 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ctdnep1Q3TP92 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ctdnep1Q3TP92 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ctdnep1Q3TP92 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ctdnep1Q3TP92 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ctdnep1Q3TP92 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ctdnep1Q3TP92 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ctdnep1Q3TP92 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ctdnep1Q3TP92 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ctdnep1Q3TP92 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ctdnep1Q3TP92 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ctdnep1Q3TP92 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ctdnep1Q3TP92 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ctdnep1Q3TP92 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ctdnep1Q3TP92 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ctdnep1Q3TP92 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ctdnep1Q3TP92 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ctdnep1Q3TP92 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ctdnep1Q3TP92 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ctdnep1Q3TP92 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ctdnep1Q3TP92 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ctdnep1Q3TP92 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ctdnep1Q3TP92 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ctdnep1Q3TP92 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ctdnep1Q3TP92 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ctdnep1Q3TP92 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ctdnep1Q3TP92 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ctdnep1Q3TP92 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ctdnep1Q3TP92 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ctdnep1Q3TP92 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ctdnep1Q3TP92 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ctdnep1Q3TP92 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ctdnep1Q3TP92 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ctdnep1Q3TP92 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ctdnep1Q3TP92 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ctdnep1Q3TP92 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ctdnep1Q3TP92 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ctdnep1Q3TP92 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ctdnep1Q3TP92 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ctdnep1Q3TP92 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ctdnep1Q3TP92 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ctdnep1Q3TP92 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ctdnep1Q3TP92 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ctdnep1Q3TP92 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ctdnep1Q3TP92 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ctdnep1Q3TP92 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ctdnep1Q3TP92 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ctdnep1Q3TP92 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ctdnep1Q3TP92 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ctdnep1Q3TP92 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ctdnep1Q3TP92 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ctdnep1Q3TP92 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ctdnep1Q3TP92 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ctdnep1Q3TP92 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ctdnep1Q3TP92 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ctdnep1Q3TP92 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ctdnep1Q3TP92 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ctdnep1Q3TP92 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ctdnep1Q3TP92 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ctdnep1Q3TP92 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ctdnep1Q3TP92 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ctdnep1Q3TP92 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ctdnep1Q3TP92 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ctdnep1Q3TP92 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ctdnep1Q3TP92 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ctdnep1Q3TP92 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ctdnep1Q3TP92 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms