Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2-M3Q31093 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-M3Q31093 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-M3Q31093 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2-M3Q31093 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-M3Q31093 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-M3Q31093 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-M3Q31093 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-M3Q31093 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-M3Q31093 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-M3Q31093 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-M3Q31093 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-M3Q31093 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-M3Q31093 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2-M3Q31093 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2-M3Q31093 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2-M3Q31093 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2-M3Q31093 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2-M3Q31093 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
H2-M3Q31093 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-M3Q31093 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-M3Q31093 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-M3Q31093 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-M3Q31093 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H2-M3Q31093 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2-M3Q31093 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-M3Q31093 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-M3Q31093 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-M3Q31093 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-M3Q31093 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-M3Q31093 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-M3Q31093 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-M3Q31093 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-M3Q31093 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-M3Q31093 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-M3Q31093 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-M3Q31093 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-M3Q31093 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-M3Q31093 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-M3Q31093 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-M3Q31093 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-M3Q31093 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-M3Q31093 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-M3Q31093 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-M3Q31093 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-M3Q31093 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-M3Q31093 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-M3Q31093 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-M3Q31093 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms