Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Col24a1Q30D77 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Col24a1Q30D77 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,44
Col24a1Q30D77 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Col24a1Q30D77 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Col24a1Q30D77 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Col24a1Q30D77 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Col24a1Q30D77 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Col24a1Q30D77 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Col24a1Q30D77 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Col24a1Q30D77 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Col24a1Q30D77 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Col24a1Q30D77 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Col24a1Q30D77 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Col24a1Q30D77 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Col24a1Q30D77 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Col24a1Q30D77 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Col24a1Q30D77 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Col24a1Q30D77 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Col24a1Q30D77 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Col24a1Q30D77 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Col24a1Q30D77 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Col24a1Q30D77 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Col24a1Q30D77 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Col24a1Q30D77 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Col24a1Q30D77 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Col24a1Q30D77 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Col24a1Q30D77 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Col24a1Q30D77 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Col24a1Q30D77 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Col24a1Q30D77 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Col24a1Q30D77 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Col24a1Q30D77 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Col24a1Q30D77 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Col24a1Q30D77 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Col24a1Q30D77 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Col24a1Q30D77 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Col24a1Q30D77 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Col24a1Q30D77 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Col24a1Q30D77 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Col24a1Q30D77 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Col24a1Q30D77 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Col24a1Q30D77 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Col24a1Q30D77 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Col24a1Q30D77 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Col24a1Q30D77 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Col24a1Q30D77 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Col24a1Q30D77 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Col24a1Q30D77 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Col24a1Q30D77 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Col24a1Q30D77 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Col24a1Q30D77 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Col24a1Q30D77 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Col24a1Q30D77 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Col24a1Q30D77 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Col24a1Q30D77 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Col24a1Q30D77 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Col24a1Q30D77 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Col24a1Q30D77 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Col24a1Q30D77 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Col24a1Q30D77 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Col24a1Q30D77 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Col24a1Q30D77 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Col24a1Q30D77 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Col24a1Q30D77 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Col24a1Q30D77 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Col24a1Q30D77 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Col24a1Q30D77 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Col24a1Q30D77 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Col24a1Q30D77 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Col24a1Q30D77 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Col24a1Q30D77 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Col24a1Q30D77 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Col24a1Q30D77 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Col24a1Q30D77 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Col24a1Q30D77 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Col24a1Q30D77 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Col24a1Q30D77 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Col24a1Q30D77 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Col24a1Q30D77 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Col24a1Q30D77 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Col24a1Q30D77 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Col24a1Q30D77 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Col24a1Q30D77 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Col24a1Q30D77 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Col24a1Q30D77 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Col24a1Q30D77 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Col24a1Q30D77 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Col24a1Q30D77 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Col24a1Q30D77 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Col24a1Q30D77 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Col24a1Q30D77 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29,7■■■□□ 2,34
Col24a1Q30D77 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Col24a1Q30D77 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Col24a1Q30D77 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Col24a1Q30D77 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Col24a1Q30D77 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Col24a1Q30D77 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Col24a1Q30D77 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Col24a1Q30D77 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms