Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Specc1lQ2KN98 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Specc1lQ2KN98 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Specc1lQ2KN98 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Specc1lQ2KN98 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Specc1lQ2KN98 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Specc1lQ2KN98 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Specc1lQ2KN98 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Specc1lQ2KN98 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Specc1lQ2KN98 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Specc1lQ2KN98 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Specc1lQ2KN98 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Specc1lQ2KN98 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Specc1lQ2KN98 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Specc1lQ2KN98 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Specc1lQ2KN98 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Specc1lQ2KN98 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Specc1lQ2KN98 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Specc1lQ2KN98 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Specc1lQ2KN98 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Specc1lQ2KN98 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Specc1lQ2KN98 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Specc1lQ2KN98 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Specc1lQ2KN98 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Specc1lQ2KN98 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Specc1lQ2KN98 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Specc1lQ2KN98 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Specc1lQ2KN98 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Specc1lQ2KN98 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Specc1lQ2KN98 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Specc1lQ2KN98 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Specc1lQ2KN98 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Specc1lQ2KN98 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Specc1lQ2KN98 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Specc1lQ2KN98 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Specc1lQ2KN98 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Specc1lQ2KN98 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Specc1lQ2KN98 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Specc1lQ2KN98 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Specc1lQ2KN98 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Specc1lQ2KN98 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Specc1lQ2KN98 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Specc1lQ2KN98 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Specc1lQ2KN98 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Specc1lQ2KN98 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Specc1lQ2KN98 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Specc1lQ2KN98 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Specc1lQ2KN98 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Specc1lQ2KN98 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Specc1lQ2KN98 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Specc1lQ2KN98 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Specc1lQ2KN98 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Specc1lQ2KN98 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Specc1lQ2KN98 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Specc1lQ2KN98 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Specc1lQ2KN98 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Specc1lQ2KN98 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Specc1lQ2KN98 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Specc1lQ2KN98 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Specc1lQ2KN98 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Specc1lQ2KN98 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Specc1lQ2KN98 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Specc1lQ2KN98 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Specc1lQ2KN98 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Specc1lQ2KN98 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Specc1lQ2KN98 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Specc1lQ2KN98 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Specc1lQ2KN98 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Specc1lQ2KN98 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Specc1lQ2KN98 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Specc1lQ2KN98 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Specc1lQ2KN98 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Specc1lQ2KN98 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Specc1lQ2KN98 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Specc1lQ2KN98 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Specc1lQ2KN98 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Specc1lQ2KN98 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Specc1lQ2KN98 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Specc1lQ2KN98 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Specc1lQ2KN98 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Specc1lQ2KN98 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Specc1lQ2KN98 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Specc1lQ2KN98 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Specc1lQ2KN98 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Specc1lQ2KN98 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Specc1lQ2KN98 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Specc1lQ2KN98 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Specc1lQ2KN98 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Specc1lQ2KN98 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Specc1lQ2KN98 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Specc1lQ2KN98 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Specc1lQ2KN98 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Specc1lQ2KN98 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Specc1lQ2KN98 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Specc1lQ2KN98 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Specc1lQ2KN98 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Specc1lQ2KN98 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Specc1lQ2KN98 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Specc1lQ2KN98 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Specc1lQ2KN98 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms