Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Edem3Q2HXL6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Edem3Q2HXL6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Edem3Q2HXL6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Edem3Q2HXL6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Edem3Q2HXL6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Edem3Q2HXL6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Edem3Q2HXL6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Edem3Q2HXL6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Edem3Q2HXL6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
Edem3Q2HXL6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Edem3Q2HXL6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Edem3Q2HXL6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Edem3Q2HXL6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Edem3Q2HXL6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Edem3Q2HXL6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Edem3Q2HXL6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Edem3Q2HXL6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Edem3Q2HXL6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Edem3Q2HXL6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Edem3Q2HXL6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Edem3Q2HXL6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Edem3Q2HXL6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Edem3Q2HXL6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Edem3Q2HXL6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Edem3Q2HXL6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Edem3Q2HXL6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Edem3Q2HXL6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Edem3Q2HXL6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Edem3Q2HXL6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Edem3Q2HXL6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Edem3Q2HXL6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Edem3Q2HXL6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Edem3Q2HXL6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Edem3Q2HXL6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Edem3Q2HXL6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Edem3Q2HXL6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Edem3Q2HXL6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Edem3Q2HXL6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Edem3Q2HXL6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Edem3Q2HXL6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Edem3Q2HXL6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Edem3Q2HXL6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Edem3Q2HXL6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Edem3Q2HXL6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Edem3Q2HXL6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Edem3Q2HXL6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Edem3Q2HXL6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Edem3Q2HXL6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Edem3Q2HXL6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Edem3Q2HXL6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Edem3Q2HXL6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Edem3Q2HXL6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,92
Edem3Q2HXL6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Edem3Q2HXL6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Edem3Q2HXL6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Edem3Q2HXL6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Edem3Q2HXL6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Edem3Q2HXL6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Edem3Q2HXL6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Edem3Q2HXL6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Edem3Q2HXL6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Edem3Q2HXL6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Edem3Q2HXL6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Edem3Q2HXL6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Edem3Q2HXL6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Edem3Q2HXL6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Edem3Q2HXL6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Edem3Q2HXL6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1,91
Edem3Q2HXL6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Edem3Q2HXL6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Edem3Q2HXL6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Edem3Q2HXL6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Edem3Q2HXL6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Edem3Q2HXL6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Edem3Q2HXL6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Edem3Q2HXL6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Edem3Q2HXL6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Edem3Q2HXL6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Edem3Q2HXL6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Edem3Q2HXL6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Edem3Q2HXL6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Edem3Q2HXL6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Edem3Q2HXL6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Edem3Q2HXL6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Edem3Q2HXL6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Edem3Q2HXL6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Edem3Q2HXL6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Edem3Q2HXL6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Edem3Q2HXL6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Edem3Q2HXL6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Edem3Q2HXL6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Edem3Q2HXL6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Edem3Q2HXL6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Edem3Q2HXL6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Edem3Q2HXL6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Edem3Q2HXL6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Edem3Q2HXL6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Edem3Q2HXL6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Edem3Q2HXL6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50,2 ms