Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lingo4Q149C3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lingo4Q149C3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lingo4Q149C3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lingo4Q149C3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lingo4Q149C3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lingo4Q149C3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lingo4Q149C3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lingo4Q149C3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lingo4Q149C3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lingo4Q149C3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lingo4Q149C3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lingo4Q149C3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lingo4Q149C3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lingo4Q149C3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lingo4Q149C3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lingo4Q149C3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms