Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc162pQ0VG85 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc162pQ0VG85 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc162pQ0VG85 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc162pQ0VG85 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc162pQ0VG85 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc162pQ0VG85 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc162pQ0VG85 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc162pQ0VG85 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc162pQ0VG85 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc162pQ0VG85 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc162pQ0VG85 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc162pQ0VG85 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc162pQ0VG85 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc162pQ0VG85 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc162pQ0VG85 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc162pQ0VG85 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc162pQ0VG85 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc162pQ0VG85 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc162pQ0VG85 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc162pQ0VG85 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc162pQ0VG85 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc162pQ0VG85 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc162pQ0VG85 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc162pQ0VG85 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc162pQ0VG85 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc162pQ0VG85 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc162pQ0VG85 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc162pQ0VG85 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc162pQ0VG85 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc162pQ0VG85 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc162pQ0VG85 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc162pQ0VG85 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc162pQ0VG85 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc162pQ0VG85 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc162pQ0VG85 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc162pQ0VG85 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc162pQ0VG85 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc162pQ0VG85 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc162pQ0VG85 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc162pQ0VG85 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc162pQ0VG85 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc162pQ0VG85 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc162pQ0VG85 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc162pQ0VG85 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc162pQ0VG85 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc162pQ0VG85 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc162pQ0VG85 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc162pQ0VG85 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc162pQ0VG85 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc162pQ0VG85 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc162pQ0VG85 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc162pQ0VG85 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc162pQ0VG85 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc162pQ0VG85 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc162pQ0VG85 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc162pQ0VG85 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc162pQ0VG85 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc162pQ0VG85 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc162pQ0VG85 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc162pQ0VG85 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc162pQ0VG85 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc162pQ0VG85 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc162pQ0VG85 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc162pQ0VG85 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc162pQ0VG85 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc162pQ0VG85 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc162pQ0VG85 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc162pQ0VG85 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc162pQ0VG85 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc162pQ0VG85 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc162pQ0VG85 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc162pQ0VG85 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc162pQ0VG85 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc162pQ0VG85 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc162pQ0VG85 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc162pQ0VG85 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc162pQ0VG85 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc162pQ0VG85 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc162pQ0VG85 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc162pQ0VG85 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc162pQ0VG85 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc162pQ0VG85 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc162pQ0VG85 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc162pQ0VG85 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc162pQ0VG85 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc162pQ0VG85 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc162pQ0VG85 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc162pQ0VG85 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc162pQ0VG85 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc162pQ0VG85 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc162pQ0VG85 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc162pQ0VG85 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc162pQ0VG85 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc162pQ0VG85 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc162pQ0VG85 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc162pQ0VG85 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms